Bom, vamos aos requisitos dos quais vamos precisar:

• Pacote ffmpeg instalado (geralmente vem com o mplayer, pode ser instalado por apt-get. Também há uma build no linuxpackages)
• 1 Browser de sua preferência.
• 1 xícara de café puro sem açúcar
• Uma tesoura sem ponta
• Cola em bastão
• 1 url de algum vídeo do youtube

Baixando o vídeo do youtube

Modo de preparo:

1. Abra o browser de sua preferência e acesse a url do vídeo do youtube. Eu vou utilizar: http://www.youtube.com/watch?v=dMR0VRb7g60 uma música dos ‘Os Nerds’ que fala de um cara que pede “me dê op no #seu_coração”, uma paródia com “here comes you’re man”.
2. Após ter carregada a página, abra o código-fonte do mesmo. (Firefox: CTRL+U).
3. Localize no meio de tudo aquilo a string “t”, sim com aspas e tudo “t”. No meu caso ele está nessa linha:

   var swfArgs = {"q": "os%20nerds%20kick%20de%20amor", "vq": null, "sourceid": "ys", "video_id": "dMR0VRb7g60", "l": 164, "sk": "C4c1AWqTMKCqlc-ps6iNq8hHDwAaAkYAU", "fmt_map": "", "usef": 0, "t": "OEgsToPDskJ9NevmQow7fOToemrym1db", "hl": "en", "plid": "AARgxT891VByDIGsAAAAoAAAAAA"};

   Viu ele? “t”: “OEgsToPDskJ9NevmQow7fOToemrym1db”

4. Copie(com a tesoura sem ponta) aquele token (OEgsToPDskJ9NevmQow7fOToemrym1db) da página do seu vídeo
5. Agora, na barra de endereços do browser, vamos trocar um pouco as coisas. o que era:
   http://www.youtube.com/watch?v=dMR0VRb7g60 vai se tornar: http://www.youtube.com/get_video?video_id=dMR0VRb7g60&t=OEgsToPDskJ9NevmQow7fOToemrym1db (Observerem que trocamos: watch por get_video, v por video_id e adicionamos &t=TOKEN), onde depois de &t= colamos com cola bastão o aquele token que retiramos do código-fonte.
6. Dando um enter, ele vai pedir pra fazer o download. Esse download é justamente o flv.
7. Enquanto baixa o vídeo, você toma a 1 xícara de café puro sem açucar.

Convertendo o Vídeo

Bom, nem todo player toca .flv, então talvez alguns queiram convertê-lo pra .mp3 ou pra .avi, .ogg ou .mpeg. Para isso, vamos utilizar o ffmpeg.

Convertendo para mp3

ffmpeg -author "Os nerds" -title "Me dê op" -i download/get_video.flv -ab 128 -ac 2 -acodec mp3 -vn -y ~/"Musicas/Os nerds - Me dê op.mp3"

Voalá! os comandos -author e -title vão mexer na IDv3 da mp3. Assim, quando executar num player, vai aparecer bonitinho o autor e a música. -ab para especificar o bitrate, -i = arquivo de entrada, e -vn = desabilita a gravação de vídeo. -y = é para sobreescrever o arquivo de destino. Ah! e o -acodec para selecionar o codec do audio e -ac o número de canais.

UPDATE
Usando o Arch Linux eu notei que o -acodec mp3 não funcionava. Portanto, caso vocês não conseguirem com -acodec mp3, tentem: -acodec libmp3lame

Convertendo para avi

ffmpeg -i download/get_video.flv -ab 56 -y ~/"Clipes/Os nerds - Me dê op.avi"

Mais parâmetros, ajuda e outras coisas: http://swoolley.org/man.cgi/1/ffmpeg
Agora você não precisa mais aqueles programinhas cheio de spyware ou ver 300 erros antes de conseguir baixar o vídeo pelo vixy.net!

Qualquer dúvida comente!